Po absolvování Právnické fakulty Masarykovy univerzity v Brně začala Markéta působit nejprve v advokacii, kde se zaměřovala na občanské, obchodní a trestní právo. Od roku 2011 svou kariéru spojila s Úřadem pro ochranu hospodářské soutěže (ÚOHS) a dozorem nad zadáváním veřejných zakázek. Postupně prošla pozicemi od referentky přes vedoucí oddělení až po ředitelku odboru veřejných zakázek, který vedla sedm let. Následně byla jmenována místopředsedkyní Úřadu pověřenou vedením Sekce veřejných zakázek a od loňska je místopředsedkyní Úřadu na šestileté funkční období. Ve svém oboru je aktivní také formou přednáškové a publikační činnosti.